Program Studi Pendidikan Profesi Insinyur (PII) dipimpin oleh seorang Ketua Program Studi dan dibantu seorang Sekretaris serta dua orang staf sekretariat. Pengelola Program bertanggungjawab kepada Dekan Fakultas Teknik USU dan dalam operasionalnya berkoordinasi dengan Ketua Departemen yang ada di lingkungan FT USU (diagram berikut).